FAU: Центр CODE для оміксних технологій та інженерії даних

Запуск нового центру CODE в FAU

Коледж інженерії та комп'ютерних наук Університету Флорида Атлантик (FAU) оголосив про запуск Центру оміксних технологій та інженерії даних (CODE). Цей міждисциплінарний дослідницький хаб покликаний просувати інновації, керовані інженерією, на перетині обчислювальних наук, науки про дані та наук про життя.

CODE об'єднує експертизу в галузі інженерії, комп'ютерних наук та медицини, щоб розробляти масштабовані та інтерпретовані обчислювальні методи. Метою є вилучення цінних знань зі складних біологічних та екологічних даних, що позиціонує FAU в авангарді відкриттів у біологічній та біомедичній сферах, інтенсивних щодо даних.

Місія та підходи

Центральною місією CODE є інтеграція та аналіз оміксних даних. Це включає геноміку (варіації ДНК та структура генів), транскриптоміку (експресія генів), протеоміку (структура та функція білків), метаболоміку (клітинні метаболічні процеси) та епігеноміку (регуляторні модифікації, що впливають на активність генів). Комбінуючи ці шари біологічної інформації, дослідники CODE прагнуть створити більш повне та прогностичне розуміння живих систем у різних масштабах.

Центр зосереджений на розробці обчислювальних та інженерних методів, які перетворюють масивні, складні біологічні та екологічні набори даних на дієві знання. За словами доктора Стелли Баталама, декана Коледжу інженерії та комп'ютерних наук, CODE "об'єднує інженерну досконалість з науками про життя для вирішення деяких з найактуальніших проблем у галузі охорони здоров'я та біотехнологій".

Керівництво та дослідницькі напрямки

CODE очолює доктор Майкл ДеДжорджіо, директор центру, а також доцент та професор кафедри електротехніки та комп'ютерних наук, а також кафедри біомедичної інженерії FAU. Під його керівництвом CODE об'єднує провідних викладачів з інженерії, комп'ютерних наук та медицини, а також наукових співробітників, постдоків та велику групу аспірантів. Ця міждисциплінарна команда пропонує комплексний досвід, від експериментального дизайну та генерації мульти-оміксних даних до передового обчислювального аналізу, розробки алгоритмів та перетворення відкриттів у практичні інструменти та інженерні біологічні та біомедичні рішення.

Дослідження, що проводяться через CODE, охоплюють широкий спектр прикладних областей, зокрема:

Геноміка популяцій та раку: Використання великомасштабних геномних наборів даних для виявлення генетичних факторів ризику та механізмів захворювань.
Інтеграція мульти-оміксних даних: З'єднання молекулярних варіацій з біологічною функцією та клінічними результатами.
Молекулярна та метаболічна інженерія: Проектування та оптимізація інженерних біологічних систем.
Синтетична біологія та біовиробництво: Моделювання, кероване даними, для розробки інженерних організмів для стійких матеріалів, терапевтичних засобів та промислових процесів.

CODE також розвиває передові обчислювальні технології, включаючи підходи на основі ШІ та машинного навчання для охорони здоров'я, квантову та апаратно-прискорену аналітику для високопродуктивних біологічних даних, а також нові фреймворки інженерії даних, що забезпечують відтворюваність, інтерпретованість та масштабованість.

Співпраця та навчання

Окрім дослідницької місії, CODE служить платформою для співпраці з промисловими партнерами, системами охорони здоров'я, державними установами та національними лабораторіями. Ці партнерства підтримують трансляційні дослідження та реальний вплив, одночасно надаючи студентам та постдокам практичний досвід у міждисциплінарних дослідженнях, спеціалізованих семінарах, програмах наставництва та спільному вирішенні проблем у академічній, клінічній та промисловій сферах.

Центр розташований у будівлі Engineering East на кампусі FAU в Бока-Ратон, де наразі триває ремонт спеціально відведеного простору.

Що це означає для розробників

Ця новина означає для розробників нові можливості у сфері обчислювальних методів, розробки алгоритмів та інженерії даних, особливо в контексті біологічних та біомедичних досліджень. CODE зосереджений на створенні масштабованих та інтерпретованих обчислювальних рішень, включаючи аналітику на основі ШІ та нові фреймворки інженерії даних, що може призвести до розробки нових інструментів та підходів для роботи зі складними біологічними даними.

Ключові факти

FAU запустив Центр оміксних технологій та інженерії даних (CODE).
CODE є міждисциплінарним дослідницьким хабом, що поєднує інженерію, комп'ютерні науки та медицину.
Центр розробляє масштабовані та інтерпретовані обчислювальні методи для аналізу біологічних та екологічних даних.
CODE інтегрує різні оміксні підходи, включаючи геноміку, транскриптоміку, протеоміку, метаболоміку та епігеноміку.
Дослідження охоплюють геноміку популяцій та раку, синтетичну біологію, біовиробництво та аналітику на основі ШІ.