FAU запускає CODE: Центр омікс-технологій та інженерії даних

FAU відкриває CODE для інновацій

Коледж інженерії та комп'ютерних наук Університету Флориди Атлантик (FAU) запустив Центр омікс-технологій та інженерії даних (CODE). Цей новий міждисциплінарний дослідницький хаб покликаний сприяти інженерним інноваціям на перетині обчислень, науки про дані та наук про життя. CODE позиціонує FAU в авангарді біологічних та біомедичних відкриттів, що базуються на даних, об'єднуючи експертизу в інженерії, комп'ютерних науках та медицині для вирішення складних проблем у галузі охорони здоров'я, біотехнологій та навколишнього середовища. Центр зосереджений на розробці масштабованих, надійних та інтерпретованих обчислювальних та інженерних методів, які перетворюють масивні, складні біологічні та екологічні набори даних на корисні знання.

Декан Коледжу інженерії та комп'ютерних наук, доктор Стелла Баталама, зазначила, що CODE є значним кроком вперед для Флориди Атлантик та зростаючої екосистеми технологій та біотехнологій Південної Флориди. Вона додала, що центр не тільки сприятиме новаторським дослідженням, але й виховуватиме висококваліфіковану робочу силу, готову очолити нові галузі, де сходяться обчислення, штучний інтелект та омікс-технології.

Міждисциплінарний підхід та керівництво

Центральною місією центру є інтеграція та аналіз омікс-даних, включаючи геноміку (варіації ДНК та структура генів), транскриптоміку (експресія генів), протеоміку (структура та функція білків), метаболоміку (клітинні метаболічні процеси) та епігеноміку (регуляторні модифікації, що впливають на активність генів). Комбінуючи ці шари біологічної інформації, дослідники CODE прагнуть побудувати більш повне та передбачувальне розуміння живих систем у різних масштабах.

Центр очолює доктор Майкл ДеДжорджіо, директор CODE, доцент та професор кафедри електротехніки та комп'ютерних наук, а також кафедри біомедичної інженерії FAU. Під його керівництвом CODE об'єднує старших викладачів з інженерії, комп'ютерних наук та медицини, а також наукових співробітників, постдоків та велику групу аспірантів. Ця міждисциплінарна команда пропонує всебічну експертизу, від експериментального дизайну та генерації мультиоміксних даних до передового обчислювального аналізу, розробки алгоритмів та перетворення відкриттів у придатні інструменти та інженерні біологічні та біомедичні рішення.

Доктор ДеДжорджіо зазначив, що CODE створює унікальну можливість переосмислити, як вивчається біологія та розробляються рішення для здоров'я людини та навколишнього середовища. Він підкреслив, що об'єднання передових обчислень, інженерії даних та мультиоміксних технологій під одним дахом дозволяє перейти від ізольованих аналізів до інтегрованих, передбачувальних моделей складних біологічних систем.

Основні напрямки досліджень та технології

Дослідження, що проводяться через CODE, охоплюють широкий спектр прикладних областей, включаючи геноміку популяцій та раку, де великомасштабні геномні набори даних використовуються для ідентифікації генетичних факторів ризику та механізмів захворювань. Також це інтеграція мультиоміксних даних, що дозволяє дослідникам пов'язувати молекулярні варіації з біологічною функцією та клінічними результатами; та молекулярна й метаболічна інженерія, яка підтримує проектування та оптимізацію інженерних біологічних систем. Додаткові напрямки включають синтетичну біологію та біовиробництво, де моделювання на основі даних керує розробкою інженерних організмів для стійких матеріалів, терапевтичних засобів та промислових процесів.

CODE також розвиває новаторські обчислювальні технології, включаючи підходи на основі ШІ та машинного навчання для здоров'я людини, квантову та апаратно-прискорену аналітику для високопродуктивних біологічних даних, а також нові фреймворки інженерії даних, що забезпечують відтворюваність, інтерпретованість та масштабованість. Ці можливості дозволяють дослідникам аналізувати набори даних, що варіюються від окремих геномів до популяційних досліджень, і від клітинних систем до екологічних даних.

Співпраця та майбутнє

Окрім дослідницької місії, CODE слугує платформою для співпраці з промисловими партнерами, системами охорони здоров'я, державними установами та національними лабораторіями. Завдяки цим партнерствам центр підтримує трансляційні дослідження та реальний вплив, одночасно надаючи студентам та постдокам практичний досвід у міждисциплінарних дослідженнях, спеціалізованих семінарах, програмах наставництва та спільному вирішенні проблем у академічних, клінічних та промислових сферах.

Доктор Баталама підтвердила, що цей центр позиціонує Флориду Атлантик в авангарді біологічних та біомедичних інновацій, керованих даними. CODE прискорить відкриття, зміцнить галузеві партнерства та ще більше підвищить дослідницький вплив університету. Спеціально відведене приміщення центру наразі перебуває на ремонті та буде розташоване в будівлі Engineering East на кампусі FAU в Бока-Ратон, забезпечуючи фізичний хаб для співпраці, навчання та інновацій у міру того, як CODE просуває майбутнє інженерії та науки про дані, що базуються на омікс-технологіях.

Що це означає для розробників

Цей центр створює нові можливості для розробників, які спеціалізуються на обчисленнях, науці про дані, розробці алгоритмів та інженерії даних. Зокрема, він сприятиме розвитку ШІ та машинного навчання, квантової та апаратно-прискореної аналітики, а також нових фреймворків для обробки біологічних та біомедичних даних.

Ключові факти

Університет Флориди Атлантик (FAU) запустив Центр омікс-технологій та інженерії даних (CODE).
CODE є міждисциплінарним дослідницьким хабом, що поєднує інженерію, комп'ютерні науки та медицину.
Центр зосереджений на розробці обчислювальних та інженерних методів для перетворення біологічних та екологічних даних на корисні знання.
Очолює CODE доктор Майкл ДеДжорджіо, а його місія включає інтеграцію та аналіз омікс-даних (геноміка, транскриптоміка, протеоміка, метаболоміка, епігеноміка).
Дослідження охоплюють геноміку популяцій та раку, інтеграцію мультиоміксних даних, молекулярну та метаболічну інженерію, а також синтетичну біологію та біовиробництво.